Определение индивидуальных аллелей HLA с помощью секвенирования следующего поколения
HLA представляет собой группу генов, которые имеют важную функцию в иммунной системе человека. Регион HLA обладает высокой полиморфностью и содержит шесть классических генов HLA: класс I HLA-A, -B и -C, и класс II HLA-DRB1, -DQB1 и -DPB1. Более того, известно, что регион HLA связан с более чем 100 многофакторными комплексными заболеваниями, в основном с воспалительным и аутоиммунным патогенезом.
Характеристика индивидуального ответа на лекарственную терапию, включая фармакогенетику
Сопоставление HLA профиля донора и реципиента для трансплантации
Один из важных факторов для проведения иммунотерапии
Преимущества секвенирования следующего поколения (NGS)
Представители CeGaT — ведущей медико-генетической лаборатории Германии и Европы
Исследования проводятся в Германии на оборудование Illumina NovaSeq 6000
Поможем вам на всех этапах исполнения проекта
Почему стоит выбрать HLA типирование в CEGAT?
HLA Flex
HLA Classic
Качество ДНК
Гибкий
Технология секвенирования
Nova Seq 6000
Виды
Человек
Виды
Человек
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Тип HLA
Класс HLA I (HLA-A, -B и –C) и класс HLA II (HLA-DRB1, -DQB1 и -DPB1)
Результат
6 Гб
Результат
Гибкий
Типирование HLA на основе
Полноэкзомного секвенирования
Технология секвенирования
Nova Seq 6000
Типирование HLA на основе
Полноэкзомного секвенирования
Тип HLA
Класс HLA I (HLA-A, -B и -C) и класс HLA II (HLA-DRB1, -DQB1 и -DPB1)
Предоставляемые услуги
Оборудование
Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 — это самый быстрый и точный прибор с точки зрения количества и качества данных за единицу времени (6 Tb за 45 часов), т. е. это более 130 Gb в час и более 2 Gb в минуту.
Результаты типирования HLA получаются из данных экзомного секвенирования с использованием специального биоинформационного алгоритма. Будут проанализированы следующие локусы: HLA класс I (HLA-A, -B и -C) и HLA класс II (HLA-DRB1, -DQB1 и -DPB1). Экзомы секвенируются в режиме 2 х 100 п.о. с использованием передовых систем секвенирования Illumina NovaSeq 6000.
Удаленный носитель
Размещение данных на защищенном сервере
физический носитель
Доставка данных на жестком диске
Два варианта получения данных
Для типирования HLA класса I и II на основе WES используется специальный алгоритм для оценки данных. В итоге Вы получите результаты типирования HLA в виде файла TSV. Мы всегда также предоставляем вам данные экзома в виде демультиплексированных и триммированных файлов FASTQ
Our vision is to make CeGaT the partner of choice for research institutions and pharmaceutical companies around the globe
Чтобы оформить заказ, укажите свои контактные данные — иначе мы не сможем с Вами связаться. Так же, вы можете добавить информацию по исследованию: количество образцов, их типе и любую другую важную и полезную для нас информацию. Это поможет нам быстрее подготовить для Вас коммерческое предложение.