Недавние исследования указывают на тесную связь между составом микробиома человека и возникновением различных заболеваний, а также реакцией на лекарственные препараты. Микробиом кишечника особенно важен, но микроорганизмы также играют важную роль в других частях тела, таких как кожа, полость рта и носа. Кроме того, микроорганизмы взаимодействуют с окружающей средой, участвуя в многих биохимических процессах и представляя важные элементы экологических экосистем. Лучшее понимание функций микроорганизмов в микробиомах, особенно труднокультивируемых, может привести к новым открытиям.
Метод метагеномного профилирования позволяет точно идентифицировать различные виды микроорганизмов (бактерии, археи, грибы, простейшие, вирусы и т. д.) в микробиоме. Через анализ фрагментов ДНК методом Shotgun-секвенирования можно анализировать функциональные гены, кодирующие ферменты, связанные с метаболическими путями.
Мониторинг заболеваний
Обнаружение микробных биомаркеров
Разработка лекарственных препаратов
Открытие новых видов микроорганизмов
Характеристика микробиомов
Области применения метагеномного секвенирования Shotgun разнообразны:
Представители CeGaT — ведущей медико-генетической лаборатории Германии и Европы
Исследования проводятся в Германии на оборудование Illumina NovaSeq 6000
Поможем вам на всех этапах исполнения проекта
Почему стоит выбрать метагеномный анализ в CEGAT?
Shotgun Metagenomics Flex
Shotgun Metagenomics Classic
15 550 руб.
ПЦР-амплификация
В зависимости от выбранного протокола
Технология секвенирования
Illumina
Типы образцов
ДНК, кал
ПЦР-амплификация
Да
Технология секвенирования
Illumina
Результат
10 М кластеров (2 Гб)
Цель
Прокариотические и Эукариотические геномы
Длина считывания
2 × 100 bp
Длина считывания
Гибкая
Результат
Гибкий
Цель
Прокариотические и Эукариотические геномы
Типы образцов
Различные типы образцов по запросу
Предоставляемые услуги
Удаленный носитель
Размещение данных на защищенном сервере
физический носитель
Доставка данных на жестком диске
Два варианта получения данных
В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Our vision is to make CeGaT the partner of choice for research institutions and pharmaceutical companies around the globe
Чтобы оформить заказ, укажите свои контактные данные — иначе мы не сможем с Вами связаться. Так же, вы можете добавить информацию по исследованию: количество образцов, их типе и любую другую важную и полезную для нас информацию. Это поможет нам быстрее подготовить для Вас коммерческое предложение.