Секвенирование РНК отдельных клеток

Изучите клеточное разнообразие на уровне одной клетки

Человеческое тело состоит из более чем 30 триллионов клеток. Все они сильно различаются по своему транскрипционному профилю, даже если они имеют общее происхождение и локализацию. Эта гетерогенность имеет две стороны: с одной стороны, это важная особенность нормальных физиологических процессов, а с другой стороны, она может способствовать развитию патологических процессов. Традиционные методы исследования РНК не способны показать гетерогенность клеточной популяции. Однако с новыми технологиями секвенирования РНК на уровне отдельных клеток теперь возможно анализировать индивидуальные транскриптомы клеток в одном образце.

Главная / Исследования / Секвенирование РНК отдельных клеток

Выявление гетерогенности опухолевых клеток

Дифференцировка клеток и отслеживание их линий

Исследования влияния лекарственных средств

Поиск и исследование биомаркеров

Области применения секвенирования РНК отдельных клеток:

Представители CeGaT —
ведущей медико-генетической лаборатории Германии и Европы

Исследования проводятся
в Германии на оборудование Illumina NovaSeq 6000 и Chromium™ system (10x Genomics®)

Поможем вам на всех этапах исполнения проекта

Почему стоит выбрать секвенирование РНК отдельных клеток в CEGAT?

Секвенирование 3' РНК отдельных клеток (3' SCR)

Виды*

Человеческие, мышиные

Технология секвенирования

Система Chromium™ (10x Genomics®)
Система NovaSeq 6000 или MiSeq (Illumina)

Результат

Гибкий

Важно:

Наши коллеги окажут вам поддержку в анализе и интерпретации данных с помощью 10X Genomics Loupe Browser

Тип образца

Замороженные суспензии отдельных клеток

Требования к образцу*

1 М клеток в 1 мл среды для криоконсервации
Жизнеспособность клеток > 90%

Предоставляемые услуги

* Возможна ограниченная кастомизация (другие виды или тип образцов, пожалуйста, свяжитесь с нами для обсуждения возможных вариантов.
М = миллион

Оборудование

Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000  и Chromium™ (10x Genomics®)

Мы можем обрабатывать от 500 до 10 000 клеток на 1 образец, и до 8 образцов можно одновременно запустить на одном чипе Chromium Next GEM.
Рекомендуется секвенировать не менее 20 000 парных прочтений на клетку. Требуемая глубина секвенирования сильно зависит от типа образца и от целей проекта. В CeGaT секвенирование выполняется с использованием передовых систем секвенирования Illumina NovaSeq 6000 и MiSeq, что обеспечивает максимальную гибкость.

Удаленный носитель

Размещение данных на защищенном сервере

физический носитель

Доставка данных на жестком диске

Два варианта получения данных

Мы обрабатываем данные секвенирования РНК отдельных клеток с использованием программного обеспечения Cell Ranger от 10x Genomics®.

Для каждого проекта вы получаете:

• Raw sequencing data (FASTQ files)
• A standard Loupe Browser visualization file (cloupe)
• Mapped count tables for downstream analysis
• A preliminary clustering analysis
• A preliminary differential gene expression analysis
• A project report, including QC values and results of the data analysis

Our vision is to make CeGaT the partner of choice for research institutions and pharmaceutical companies around the globe

Контакты для связи

Представитель CeGaT GmbH

Общество с ограниченной ответственностью
"АЛЬГАВИТАПРО"
ИНН 7608035377
ОГРН 1187627012957

Закажите секвенирование РНК отдельных клеток в CeGat

Чтобы оформить заказ, укажите свои контактные данные — иначе мы не сможем с Вами связаться.
Так же, вы можете добавить информацию по исследованию: количество образцов, их типе и любую другую важную и полезную для нас информацию. Это поможет нам быстрее подготовить для Вас коммерческое предложение.

Информация по исследованию