Главная / Исследования / Транскриптомный анализ

Транскриптомный анализ

Транскриптом определяется как совокупность всех РНК, присутствующих в определенной ткани или организме в определенный момент времени. Их наличие и количество соответствуют текущему метаболическому состоянию клеток и зависит от многих фаторов. Секвенирование транскриптома позволяет обнаруживать и проводить относительную количественную оценку молекул РНК. Области применения и цели секвенирования транскриптома в научной сфере разнообразны и варьируются от анализа дифференциальной экспрессии генов до выявления альтернативного сплайсинга и ранее неизвестных транскриптов.

Связь между геномом и функцией гена

Области применения и цели секвенирования транскриптома:

Анализ дифференциальной экспрессии генов

Исследование альтернативного сплайсинга

Обнаружение ранее неизвестных транскриптов

Почему стоит выбрать секвенирование транскриптома в CEGAT?

Представители CeGaT —
ведущей медико-генетической лаборатории Германии и Европы

Исследования проводятся
в Германии на оборудование Illumina NovaSeq XP и 6000

Поможем вам на всех  этапах исполнения проекта

Предоставляемые услуги

TS Flex

WTS Classic Deep

мРНК, общая РНК

РНК-мишень

Эукариоты (среди них растения и грибы), прокариоты

Виды

Зависит от выбранного протокола

Качество РНК и исходный материал

Illumina

Технология секвенирования

Гибкий

Результат

от 32 000 руб.

WTS Classic

28 500 руб.

CTS Classic

Различное качество

Качество РНК и исходный материал

Illumina

Технология секвенирования

Человек, мышь, крыса

Виды

мРНК

РНК-мишень

Млекопитающие, эукариоты

Виды

RIN > 8

Качество РНК и исходный материал

Illumina

Технология секвенирования

тотальная РНК

РНК-мишень

6 Гб (30 М кластеров)

Результат

6 Гб (30 М кластеров)

Результат

Общая РНК

РНК-мишень

РНК-мишень

Человек, мышь, крыса

Виды

Illumina

Технология секвенирования

10 Гб (50 М кластеров)

Результат

Различное качество, возможность низкого ввода

Качество РНК и исходный материал

CTS (mRNA)
Рекомендуемое количество: ≥ 1 мкг РНК
Рекомендуемая концентрация: ≥ 40 нг/мкл
Рекомендуемый объем: 25 мкл
Рекомендуемое качество RIN ≥ 8

Требования к образцам

WTS (total RNA)
Рекомендуемое количество: ≥ 1 мкг РНК
Рекомендуемая концентрация: ≥ 40 нг/мкл
Рекомендуемый объем: 25 мкл
Рекомендуемое качество RIN ≥ 3

TS Flex (small RNA)
Рекомендуемое количество: ≥ 1 мкг РНК
Рекомендуемая концентрация: ≥ 40 нг/мкл
Рекомендуемый объем: 25 мкл
Рекомендуемое качество RIN ≥ 8

Пожалуйста, определите концентрацию вашего образца с использованием флуориметрического метода (например, Qubit). Качество вашего образца рекомендуется дополнительно оценить с помощью Bioanalyzer или определения оптической плотности (OD 260/280 ~ 2,0). Образцы РНК необходимо обработать ферментом DNase.

Оборудование

Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 — это самый быстрый и точный прибор с точки зрения количества и качества данных за единицу времени (6 Tb за 45 часов), т. е. это более 130 Gb в час и более 2 Gb в минуту.

Образцы TS секвенируются в режиме 2 x 150 bp или 2 x 100 bp

Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.

Два варианта получения данных

В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны

Удаленный носитель

Размещение данных на защищенном сервере

физический носитель

Доставка данных на жестком диске

Информация по исследованию

Чтобы оформить заказ, укажите свои контактные данные — иначе мы не сможем с Вами связаться.
Так же, вы можете добавить информацию по исследованию: количество образцов, их типе и любую другую важную и полезную для нас информацию. Это поможет нам быстрее подготовить для Вас коммерческое предложение.

Закажите секвенирование транскриптома в CeGat

Our vision is to make CeGaT the partner of choice for research institutions and pharmaceutical companies around the globe

Контакты для связи

Представитель CeGaT GmbH

Общество с ограниченной ответственностью
"АЛЬГАВИТАПРО"
ИНН 7608035377
ОГРН 1187627012957