Транскриптом определяется как совокупность всех РНК, присутствующих в определенной ткани или организме в определенный момент времени. Их наличие и количество соответствуют текущему метаболическому состоянию клеток и зависит от многих фаторов. Секвенирование транскриптома позволяет обнаруживать и проводить относительную количественную оценку молекул РНК. Области применения и цели секвенирования транскриптома в научной сфере разнообразны и варьируются от анализа дифференциальной экспрессии генов до выявления альтернативного сплайсинга и ранее неизвестных транскриптов.
Пожалуйста, определите концентрацию вашего образца с использованием флуориметрического метода (например, Qubit). Качество вашего образца рекомендуется дополнительно оценить с помощью Bioanalyzer или определения оптической плотности (OD 260/280 ~ 2,0). Образцы РНК необходимо обработать ферментом DNase.
Оборудование
Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 — это самый быстрый и точный прибор с точки зрения количества и качества данных за единицу времени (6 Tb за 45 часов), т. е. это более 130 Gb в час и более 2 Gb в минуту.
Образцы TS секвенируются в режиме 2 x 150 bp или 2 x 100 bp
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
Удаленный носитель
Размещение данных на защищенном сервере
физический носитель
Доставка данных на жестком диске
Два варианта получения данных
В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Our vision is to make CeGaT the partner of choice for research institutions and pharmaceutical companies around the globe
Чтобы оформить заказ, укажите свои контактные данные — иначе мы не сможем с Вами связаться. Так же, вы можете добавить информацию по исследованию: количество образцов, их типе и любую другую важную и полезную для нас информацию. Это поможет нам быстрее подготовить для Вас коммерческое предложение.