Транскриптомный анализ

Связь между геномом и функцией гена

Транскриптом определяется как совокупность всех РНК, присутствующих в определенной ткани или организме в определенный момент времени. Их наличие и количество соответствуют текущему метаболическому состоянию клеток и зависит от многих фаторов. Секвенирование транскриптома позволяет обнаруживать и проводить относительную количественную оценку молекул РНК. Области применения и цели секвенирования транскриптома в научной сфере разнообразны и варьируются от анализа дифференциальной экспрессии генов до выявления альтернативного сплайсинга и ранее неизвестных транскриптов.

Главная / Исследования / Транскриптомный анализ

Анализ дифференциальной экспрессии генов

Исследование альтернативного сплайсинга

Обнаружение ранее неизвестных транскриптов

Области применения и цели секвенирования транскриптома:

Представители CeGaT —
ведущей медико-генетической лаборатории Германии и Европы

Исследования проводятся
в Германии на оборудование Illumina NovaSeq XP и 6000

Поможем вам на всех  этапах исполнения проекта

Почему стоит выбрать секвенирование транскриптома в CEGAT?

РНК-мишень

мРНК, тотальная РНК

Виды

Эукариоты (среди них растения и грибы), прокариоты

Качество РНК и исходный материал

Зависит от выбранного протокола

Технология секвенирования

Illumina

Результат

Гибкий

WTS Classic

43 050 руб.

45 950 руб.

CTS Classic

32 950 руб.

Качество РНК и исходный материал

Различное качество

Технология секвенирования

Illumina

Виды

Человек, мышь, крыса

РНК-мишень

мРНК

Виды

Млекопитающие, эукариоты

Качество РНК и исходный материал

RIN > 8

Технология секвенирования

Illumina

РНК-мишень

тотальная РНК

Результат

6 Гб (30 М кластеров)

Результат

6 Гб (30 М кластеров)

РНК-мишень

РНК-мишень

Тотальная РНК

Виды

Человек, мышь, крыса

Технология секвенирования

Illumina

Результат

10 Гб (50 М кластеров)

Качество РНК и исходный материал

Различное качество, возможность низкого ввода

Предоставляемые услуги

TS Flex

WTS Classic Deep

Требования к образцам

CTS (mRNA)
Рекомендуемое количество: ≥ 1 мкг РНК
Рекомендуемая концентрация: ≥ 40 нг/мкл
Рекомендуемый объем: 25 мкл
Рекомендуемое качество RIN ≥ 8

WTS (total RNA)
Рекомендуемое количество: ≥ 1 мкг РНК
Рекомендуемая концентрация: ≥ 40 нг/мкл
Рекомендуемый объем: 25 мкл
Рекомендуемое качество RIN ≥ 3

TS Flex (small RNA)
Рекомендуемое количество: ≥ 1 мкг РНК
Рекомендуемая концентрация: ≥ 40 нг/мкл
Рекомендуемый объем: 25 мкл
Рекомендуемое качество RIN ≥ 8

Пожалуйста, определите концентрацию вашего образца с использованием флуориметрического метода (например, Qubit). Качество вашего образца рекомендуется дополнительно оценить с помощью Bioanalyzer или определения оптической плотности (OD 260/280 ~ 2,0). Образцы РНК необходимо обработать ферментом DNase.

Оборудование

Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 — это самый быстрый и точный прибор с точки зрения количества и качества данных за единицу времени (6 Tb за 45 часов), т. е. это более 130 Gb в час и более 2 Gb в минуту.

Образцы TS секвенируются в режиме 2 x 150 bp или 2 x 100 bp

Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.

Удаленный носитель

Размещение данных на защищенном сервере

физический носитель

Доставка данных на жестком диске

Два варианта получения данных

В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны

Our vision is to make CeGaT the partner of choice for research institutions and pharmaceutical companies around the globe

Контакты для связи

Представитель CeGaT GmbH

Общество с ограниченной ответственностью
"АЛЬГАВИТАПРО"
ИНН 7608035377
ОГРН 1187627012957

Закажите секвенирование транскриптома в CeGat

Чтобы оформить заказ, укажите свои контактные данные — иначе мы не сможем с Вами связаться.
Так же, вы можете добавить информацию по исследованию: количество образцов, их типе и любую другую важную и полезную для нас информацию. Это поможет нам быстрее подготовить для Вас коммерческое предложение.

Информация по исследованию